중국과학원(Chinese Academy of Sciences; (중국어 간체자: 中国科学院, 정체자: 中國科學院, 병음: Zhōngguó Kēxuéyuàn))는 중화인민공화국의 국립 자연과학연구소이다. 과거 한때에는 라틴어 식으로 "Academia Sinica"라는 명칭을 사용하였으나, 중화민국 혹은 타이완에 위치한 타이완 중앙연구원이 이 명칭을 널리 사용하고 있어, 혼동을 피하기 위해서 현재의 영문 명칭으로 변경하였다. 베이징에 본부가 있으나, 부속 기관들이 중국 곳곳에 널려 있다.

중국과학원에는 다섯 개의 분과가 있는데, 이 분과들은 수학, 물리학, 화학, 지구과학, 기술이다. 그리고 11개의 분소들이 선양, 창춘, 상하이, 난징, 우한, 광저우, 청두, 쿤밍, 시안, 란저우, 신장 위구르 자치구에 위치해 있다. 그리고 84개의 부속 기관들이 있으며, 2 대학교 (중국과학기술대학교, 중국과학원대학교)와 기타 정보기관, 기술 지원센터들과 출판 보도국들을 가지고 있다. 이들 기관들은 중국 전역의 20개 성에 흩어져 있다.

중국과학원은 적어도 430개 이상의 과학기술 관련 사업들을 11개의 산업체들과 공동으로 수행하고 있고, 이 산업체들 중 8개는 주식시장에 상장되어 있다.