한국보건산업진흥원법에 근거하여 설립된 위탁집행형 준정부기관. 보건산업을 키우고 보건서비스의 질을 높이기 위한 지원을 전문적으로 하는 준정부기관. 1999년 2월 문을 열었고, 2010년 11월 청사를 충청북도 청원군 오송 보건의료 행정타운으로 옮겼다.

제약 산업의 투명성을 높이고 건전한 산업으로 발달시키거나 유망한 의료기기 제조업체를 육성하기 위한 전략을 짜는 등 보건 산업 활성화를 위한 정책을 기획한다. 보건산업의 발전 방향과 이것이 미치는 영향도 분석한다. 의약품이나 보건산업의 주요 통계를 직접 내고 이를 토대로 시장분석, 의료서비스 산업의 성장률을 비롯한 흐름을 분석한다. 중요한 이슈가 있으면 전문가 토론을 열거나 포럼집을 펴낸다. 의료기관을 평가하고 영양플러스 사업, 어린이 먹을거리 안전관리 사업단을 운영하는 등 정부사업도 진행한다. 그 밖에도 발전된 기술을 수입하거나 해외로 수출하고, 전문적인 기술을 체계적으로 관리, 중개, 발전시키는 역할을 한다.

보건산업체를 세우거나 기존 보건산업체가 특허를 얻기 위해 거쳐야 하는 곳이기도 하다. 인허가 뿐 아니라 보건산업 발전과 해외 진출을 위한 지원도 받을 수 있다.