국립종자원(國立種子院, Korea Seed & Variety Service)은 대한민국 농림축산식품부의 소속기관이다. 2007년 11월 30일 발족하였으며, 경상북도 김천시 혁신8로 119에 위치하고 있다. 원장은 고위공무언단 나등급에 속하는 임기제공무원으로 보한다.