세이칸 터널(일본어: 青函トンネル 세이칸톤네루[*])은 일본의 혼슈와 홋카이도 사이의 쓰가루 해협을 관통하여 두 지역을 연결하는 해저 터널로, 아오모리 현 히가시쓰가루 군 이마베쓰 정과 홋카이도 가미이소 군 시리우치 정을 잇는다.
1961년 3월 23일에 공사가 개시되었고, 27년만인 1988년 3월 13일에 개통되었다. 터널 개통시는 가이쿄 선(협궤)만이 지났으나, 2016년 3월 26일에 홋카이도 신칸센(표준궤)도 이 터널을 지날 수 있도록 궤도 1선을 추가해 3선 궤도로 개통하였다.
터널 중 일부는 TBM 공법이나 NATM 공법으로 시공된 곳도 있으나, 대부분이 재래식 공법으로 시공되었다. 터널의 총길이는 53.85 km로 이 중 해저구간이 23.3 km이고, 최저 지점은 해발 -240 m로 수심 140 m인 해저(海底)보다 100 m 아래에 위치하고 있다.
세계에서 가장 긴 터널이였으나, 2016년 6월 1일에 스위스의 고트하르트 베이스 터널이 개통되어 세계에서 두 번째로 긴 터널이 되었다.