1992년 9월 톱텍엔지니어링으로 설립하여 1996년 6월 지금의 명칭인 (주)톱텍으로 상호를 변경하고 법인으로 전환하였다. 2005년 7월 기업부설연구소를 개설하였고, 2007년 10월 기술혁신형중소기업(INNO-BIZ)으로 선정되었다. 2008년 6월 신재생에너지 전문기업으로 등록하였고, 2008년 7월 NANO설비가 중소기업 기술혁신 개발사업으로 선정되었다. 2009년 9월 코스닥시장에 상장하였다. 2011년 5월 종이상자 자동접이기를 개발완료하였고, 10월에는 벤처기업대상 국무총리표창을 수상했다.

주요사업은 공장자동화(Factory Automation) 산업 전문기업으로 디스플레이(LCD. OLED), 2차전지, 자동차부품, 반도체 등의 제조 장비사업을 중심으로 태양광 관련 사업, 나노섬유 제조장비 및 2차전지 관련 사업 등 이다. 자회사로는 톱텍에이치앤에스(주)가 있다.

톱텍은 삼성디스플레이 유기발광다이오드(OLED) 엣지패널의 핵심 기술을 중국으로 빼돌려 약 155억원 상당의 부당이득을 취한 혐의를 받고 있다.

톱텍이 중국에 유출했다고 의심받는 기술은 삼성디스플레이의 '플렉서블 OLED 패널 3차원(3D) 라미네이션(Lamination)' 관련 설비 사양서와 패널 도면 등으로 알려졌다. 이 기술은 삼성전자 프리미엄 스마트폰에 적용돼 온 것으로, 산업기술보호법상 '국가핵심기술'에 해당한다고 검찰은 주장했다.