클루아니 국립공원 보호구역(프랑스어: Parc National et réserve de parc National de Kluane)는 유콘 영토의 남서쪽 구석에 있는 캐나다의 국립공원 시스템의 두 단위다. 알래스카 국경 근처에 있다. 클루아니 국립공원 보호구역은 1972년에 22,013 평방 킬로미터(8,499 평방 마일)에 걸쳐 설립되었다.

캐나다에서 가장 높은 산인 세인트엘리아스 산맥의 로건 산(5959m 또는 19551피트)이 포함되어 있다. 산과 빙하가 공원의 지형의 83%를 차지하고 있다. 공원의 나머지 땅은 숲과 툰드라, 즉 가장 큰 산과 빙하의 동쪽인데, 공원의 서쪽과 남쪽 지역보다 기후가 더 춥고 건조하다. 나무는 공원의 가장 낮은 고도에서만 자란다. 주된 나무 종은 white spruce, balsam poplar and trembling aspen 등이다.